Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EIF4ENIF1Q9NRA8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EIF4ENIF1Q9NRA8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EIF4ENIF1Q9NRA8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EIF4ENIF1Q9NRA8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms