Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SEC31BQ9NQW1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SEC31BQ9NQW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SEC31BQ9NQW1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEC31BQ9NQW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms