Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NECTIN3Q9NQS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NECTIN3Q9NQS3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NECTIN3Q9NQS3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms