Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASCL3Q9NQ33 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASCL3Q9NQ33 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASCL3Q9NQ33 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms