Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA4BQ9NPR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA4BQ9NPR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA4BQ9NPR2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA4BQ9NPR2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms