Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMG20AQ9NP66 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMG20AQ9NP66 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMG20AQ9NP66 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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