Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP29Q9HBJ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP29Q9HBJ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP29Q9HBJ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP29Q9HBJ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP29Q9HBJ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP29Q9HBJ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP29Q9HBJ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP29Q9HBJ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP29Q9HBJ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP29Q9HBJ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms