Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ELL3Q9HB65 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ELL3Q9HB65 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ELL3Q9HB65 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms