Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PRKRIP1Q9H875 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PRKRIP1Q9H875 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PRKRIP1Q9H875 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PRKRIP1Q9H875 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRKRIP1Q9H875 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms