Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7P6

MVB12B, Multivesicular body subunit 12B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12BQ9H7P6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MVB12BQ9H7P6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MVB12BQ9H7P6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MVB12BQ9H7P6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms