Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCXQ9H320 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCXQ9H320 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms