Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF4Q9H2L5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RASSF4Q9H2L5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RASSF4Q9H2L5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF4Q9H2L5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF4Q9H2L5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF4Q9H2L5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF4Q9H2L5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RASSF4Q9H2L5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF4Q9H2L5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RASSF4Q9H2L5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms