Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC68Q9H2F9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC68Q9H2F9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC68Q9H2F9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC68Q9H2F9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms