Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKRN2Q9H000 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MKRN2Q9H000 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MKRN2Q9H000 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms