Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CTDSP1Q9GZU7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTDSP1Q9GZU7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms