Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMEM39BQ9GZU3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM39BQ9GZU3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM39BQ9GZU3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM39BQ9GZU3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM39BQ9GZU3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms