Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LNPKQ9C0E8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LNPKQ9C0E8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LNPKQ9C0E8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LNPKQ9C0E8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms