Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4CQ9C0C4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4CQ9C0C4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA4CQ9C0C4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA4CQ9C0C4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms