Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HDAC8Q9BY41 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HDAC8Q9BY41 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDAC8Q9BY41 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDAC8Q9BY41 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms