Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RNF17Q9BXT8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RNF17Q9BXT8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RNF17Q9BXT8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RNF17Q9BXT8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RNF17Q9BXT8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms