Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAPPA2Q9BXP8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PAPPA2Q9BXP8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PAPPA2Q9BXP8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PAPPA2Q9BXP8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms