Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMIM2Q9BVW6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM2Q9BVW6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM2Q9BVW6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms