Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SELENOOQ9BVL4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SELENOOQ9BVL4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SELENOOQ9BVL4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms