Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DSCC1Q9BVC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSCC1Q9BVC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DSCC1Q9BVC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DSCC1Q9BVC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DSCC1Q9BVC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DSCC1Q9BVC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DSCC1Q9BVC3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSCC1Q9BVC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
DSCC1Q9BVC3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSCC1Q9BVC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSCC1Q9BVC3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSCC1Q9BVC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DSCC1Q9BVC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms