Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCMBPQ9BTE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCMBPQ9BTE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCMBPQ9BTE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms