Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLSTN3Q9BQT9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLSTN3Q9BQT9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLSTN3Q9BQT9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLSTN3Q9BQT9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms