Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLX1AQ9BQ83 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX1AQ9BQ83 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLX1AQ9BQ83 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms