Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3CQ99985 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3CQ99985 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA3CQ99985 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3CQ99985 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms