Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDNQ99608 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDNQ99608 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDNQ99608 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDNQ99608 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDNQ99608 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDNQ99608 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDNQ99608 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NDNQ99608 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDNQ99608 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDNQ99608 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDNQ99608 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDNQ99608 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDNQ99608 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDNQ99608 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDNQ99608 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDNQ99608 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NDNQ99608 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDNQ99608 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDNQ99608 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDNQ99608 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDNQ99608 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDNQ99608 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDNQ99608 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDNQ99608 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDNQ99608 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NDNQ99608 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDNQ99608 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDNQ99608 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDNQ99608 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDNQ99608 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDNQ99608 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDNQ99608 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDNQ99608 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDNQ99608 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDNQ99608 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDNQ99608 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDNQ99608 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDNQ99608 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDNQ99608 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDNQ99608 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDNQ99608 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDNQ99608 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDNQ99608 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDNQ99608 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDNQ99608 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDNQ99608 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDNQ99608 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDNQ99608 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDNQ99608 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDNQ99608 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDNQ99608 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDNQ99608 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDNQ99608 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NDNQ99608 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDNQ99608 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDNQ99608 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDNQ99608 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NDNQ99608 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDNQ99608 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDNQ99608 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDNQ99608 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDNQ99608 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDNQ99608 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNQ99608 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNQ99608 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNQ99608 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDNQ99608 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms