Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EYA3Q99504 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EYA3Q99504 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EYA3Q99504 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EYA3Q99504 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms