Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD180Q99467 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD180Q99467 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD180Q99467 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD180Q99467 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD180Q99467 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD180Q99467 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD180Q99467 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD180Q99467 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD180Q99467 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD180Q99467 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD180Q99467 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD180Q99467 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD180Q99467 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CD180Q99467 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD180Q99467 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD180Q99467 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD180Q99467 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD180Q99467 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD180Q99467 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD180Q99467 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD180Q99467 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD180Q99467 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD180Q99467 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD180Q99467 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD180Q99467 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD180Q99467 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD180Q99467 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD180Q99467 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD180Q99467 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD180Q99467 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD180Q99467 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD180Q99467 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD180Q99467 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD180Q99467 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD180Q99467 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD180Q99467 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD180Q99467 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD180Q99467 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD180Q99467 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD180Q99467 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD180Q99467 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD180Q99467 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD180Q99467 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD180Q99467 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD180Q99467 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD180Q99467 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD180Q99467 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD180Q99467 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD180Q99467 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD180Q99467 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD180Q99467 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD180Q99467 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD180Q99467 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD180Q99467 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD180Q99467 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD180Q99467 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD180Q99467 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD180Q99467 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD180Q99467 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD180Q99467 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD180Q99467 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD180Q99467 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD180Q99467 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD180Q99467 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD180Q99467 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD180Q99467 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD180Q99467 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD180Q99467 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD180Q99467 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD180Q99467 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD180Q99467 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD180Q99467 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD180Q99467 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD180Q99467 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD180Q99467 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD180Q99467 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD180Q99467 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD180Q99467 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD180Q99467 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD180Q99467 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms