Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY1Q96T51 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY1Q96T51 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms