Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMF1Q96S06 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMF1Q96S06 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMF1Q96S06 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMF1Q96S06 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms