Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC41.28■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC41.27■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
IFT140Q96RY7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC41.25■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC41.21■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
IFT140Q96RY7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.19■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
IFT140Q96RY7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC41.07■■■■■ 4.17
IFT140Q96RY7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC41.05■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
IFT140Q96RY7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms