Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UIMC1Q96RL1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UIMC1Q96RL1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UIMC1Q96RL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms