Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPR78Q96P69 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPR78Q96P69 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPR78Q96P69 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPR78Q96P69 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms