Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU7

AMDHD1, Probable imidazolonepropionase, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMDHD1Q96NU7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AMDHD1Q96NU7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AMDHD1Q96NU7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms