Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SAMD11Q96NU1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SAMD11Q96NU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SAMD11Q96NU1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMD11Q96NU1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms