Protein–RNA interactions for Protein: Q96N03

VSTM2L, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2LQ96N03 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VSTM2LQ96N03 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSTM2LQ96N03 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSTM2LQ96N03 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VSTM2LQ96N03 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms