Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM20AQ96MK3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM20AQ96MK3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM20AQ96MK3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM20AQ96MK3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM20AQ96MK3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM20AQ96MK3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM20AQ96MK3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM20AQ96MK3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM20AQ96MK3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM20AQ96MK3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms