Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf72Q96LT7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf72Q96LT7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C9orf72Q96LT7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms