Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFT74Q96LB3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
IFT74Q96LB3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT74Q96LB3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms