Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKNOX2Q96KN3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PKNOX2Q96KN3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKNOX2Q96KN3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms