Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABS1Q96KC9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CABS1Q96KC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CABS1Q96KC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CABS1Q96KC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms