Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMEM87BQ96K49 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM87BQ96K49 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM87BQ96K49 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM87BQ96K49 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms