Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDHR1Q96JP9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDHR1Q96JP9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDHR1Q96JP9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDHR1Q96JP9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms