Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A3Q96HJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A3Q96HJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A3Q96HJ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A3Q96HJ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms