Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPNQ96H22 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPNQ96H22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms