Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BICD1Q96G01 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BICD1Q96G01 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BICD1Q96G01 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BICD1Q96G01 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BICD1Q96G01 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BICD1Q96G01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BICD1Q96G01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BICD1Q96G01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 318.5 ms