Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NEIL1Q96FI4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NEIL1Q96FI4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NEIL1Q96FI4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms